所有类型的切削液都容易被微生物污染，被污染切削液的使用寿命将显著降低。依靠切削液生产过程中的加热及防腐杀菌剂作用，水基切削液的原液可以处于基本灭菌状态。但在工作液中，通过供液系统、稀释水、被加工零件、机床、操作人员的手以及空气接触，会带入微生物菌种。

水基切削液中含有微生物生长繁殖所需的营养物质，例如：油脂、矿物油等有机物，从空气中溶解的氧（好氧性细菌生长所需的物质），胺和酰胺类化合物等含有的氮（氮是分解氨基酸所需的物质），防锈剂中的矿物质磷、硫以及水中含有的微量元素等；又有水分和适宜的温度，这样的环境很适合于微生物的生长和繁殖。若不加以控制，微生物会以异常惊人的速度繁殖。

细菌污染

切削液中的很多成分都可能滋生细菌，这些成分包括切削液的集中液、浮油（加工中泄漏的润滑油和液压油）、水中的矿物质和其他污染物。切削液中细菌生长率越高，切削液腐蚀得越快。细菌的繁殖生成大量的酸，降低了制剂的pH值，加剧制剂的腐蚀，降低了切削液的润滑性能。细菌生成的酸还会分解金属碎片和粉末，加剧了工业制剂被定义为危险废液的可能。细菌还可能是液体变得很黑，导致设备部件被着色。

好氧菌和厌氧菌

导致液体腐败的大多数细菌都是好氧菌。换句话说就是他们需要在氧气充足的环境中生存。污染工业制剂的也有可能是厌氧菌（在缺乏氧气的环境下生长）。厌氧菌容易在系统中长时间不运行的区域生长。当切削液中的氧气减少，造成好氧菌的死亡，厌氧菌随即开始滋生。

在周末或节假日，工厂休息，切削液处于静止状态，好氧性细菌的繁殖使切削液中含氧量减少，切削液变为缺氧状态，助长厌氧菌的繁殖。当休息结束、机床开动、切削液循环时，车间内就会充满硫化氢臭气。“星期一早上的臭鸡蛋气味”就是这种细菌异常繁殖的结果。

真菌

真菌包括霉菌和酵母菌，会分解工业制剂，使其中的防锈剂变少。真菌还会发出霉味或像植物霉菌一样的臭味，在系统设备部件表面形成黏滑的，类似橡胶的物质，最终将堵塞液体管道。

在一般情况下，如果活菌数的增长超过某一极限，则会因为营养物不足和自身的分泌物引起的污染而死亡。但由于工作液总要定期补充新鲜的水和原液，于是微生物繁殖得以反复进行。最终将导致切削液严重腐败变质。